几乎与此同时，京师九门之中，防守相对薄弱的东直门、朝阳门，守将或其亲信，或被收买，或本就心怀异志，在城内某些势力（与陈大勇之乱未必同源，但趁乱牟利的心思一致）的配合下，悄然打开了城门！虽然很快被巡城御史和忠于皇帝的禁军发现，爆发激战，试图重新夺回城门控制权，但乱兵和部分趁机作乱的地痞流氓、甚至是某些家族蓄养的死士，已经涌入城内，与守军在各处街巷爆发了零星但激烈的战斗。火光，开始在这座帝国的心脏地带零星燃起，哭喊声、厮杀声、金铁交鸣声，打破了夜的死寂。
宫廷之内，亦不平静。就在皇帝于乾元殿咆哮发令之时，后宫深处，突然传来一阵凄厉的尖叫和哭喊——一位颇得圣心、育有皇子的年轻嫔妃，在其寝宫“暴病而亡”，死状蹊跷。紧接着，又有流言在太监宫女中飞速传播，说太子听闻天象示警，担忧皇帝安危，已调东宫六率“入卫”，此刻正在赶来“护驾”的路上！此言一出，本就紧绷的神经瞬间断裂，忠于皇帝的禁军与听闻消息赶来、意图不明的东宫卫士，在通往内宫的几处要道发生了对峙，剑拔弩张，一触即发！
皇帝闻讯，又惊又怒，疑心太子趁机逼宫，一边严令禁军将东宫卫士“挡在宫门之外，敢有擅入者格杀勿论”，一边紧急召见执掌京城防卫的另外几位将领和勋贵，却发现有人称病不出，有人联络不上，有人则态度暧昧不明……嘉明帝突然发现，自己坐了几十年的龙椅，似乎在这一夜之间，变得摇摇欲坠，连身边最亲近的侍卫和臣子，都变得面目可疑。
而这，仅仅是神京一隅。当夜，帝国各处，尤其是那些早已暗流汹涌之地，如同被点燃的炸药桶，接连炸响！
河北，白莲教余孽与当地因连年歉收、官府盘剥而活不下去的流民合流，打出“弥勒降世，明王再生，双星陨，新主出”的旗号，攻破数座县城，开仓放粮，裹挟民众，声势迅速壮大，地方官军围剿不利，反被击溃，告急文书雪片般飞向京城。
山东，漕运关键节点，数万漕工因漕粮拖欠、工头克扣，本就怨气冲天，又有闻香教等秘密教门暗中串联，借着“天降异象，大明将亡”的流言，一夜之间，数处重要码头、漕船被焚，押运官兵被杀，漕运为之中断。运河