，便借机发难，罗织罪名诬告孙德林妄言灾异、夸大事端、惊扰朝野。 孙德林当即被打入天牢，等候发落。 孙德林身陷囹圄，仍在狱中反复上表申诉，力证自己所言非虚，此症确为疫症，恳请朝廷与太医署早做防备。 可从深冬至残冬，天气渐暖，城中始终未见大规模疫病爆发，狱卒与官吏只当他是疯癫狡辩，对其申诉一概置之不理。