除此之外，李世民对整场变局始终心存分寸：弑兄杀弟的核心恶名，由自己一人独担，绝不牵连心腹重臣。他宁愿所有争议、骂名归于自身，也不愿让麾下谋臣武将背负犯上弑主、屠戮皇亲的千古污名，故而刻意布局，让李世勣置身封赏之外、超然事功之上。
朝堂人事洗牌继续推进，李世民刻意重用东宫旧臣、彰显宽宏，彻底瓦解旧势力、融合新旧朝堂。
原太子洗马魏征，此前屡屡劝谏李建成尽早除掉李世民、杜绝后患，是东宫核心谋臣、秦王昔日劲敌。
李建成败亡后，李世民特意传召魏征入宫，当庭故作诘问：“你昔日屡屡离间我兄弟、挑拨储位纷争，是何用意？”
当时殿内群臣皆为魏征惶恐揪心，以为其必死无疑。不料魏征神色坦然、举止自若，直言应答：“倘若故太子早日听从臣下谏言、早除祸患，断无今日身死国灭、大厦倾覆的下场！”
李世民早在瓦岗时期便熟知魏征秉性，深知其性情耿直、才略无双、忠心任事，此番诘问本就是刻意为之的作态收心之举。
他一则爱惜魏征绝世之才，二则欲借善待魏征，安抚所有东宫旧臣、瓦岗旧部，彰显自己不念旧恶、唯才是举、胸襟宽广。
于是问话过后，李世民即刻收敛神色、转怒为敬，对魏征礼待有加、破格擢升，授其詹事主簿，步入新朝核心。
随后，李世民特意将此前因东宫党争被流放巂州的王珪、韦挺尽数召回长安，与魏征一同授为谏议大夫，执掌言路、规谏朝政，彻底完成东宫旧臣的收编重用。
同时，命忠勇老将屈突通镇守洛阳、授陕东道行台左仆射，稳固关东根本重地，杜绝天下隐患。
随后数月，军方、中枢高层持续完成全面更迭：
武德九年七月三十一日，秦琼授左武卫大将军，程知节授右武卫大将军，尉迟恭授右武侯大将军，秦府三大顶级武将执掌京城禁军核心。
八月初三，中枢宰辅格局定型：高士廉为侍中，房玄龄为中书令，萧瑀为左仆射，长孙无忌为吏部尚书，杜如晦为兵部尚书，文臣核心班底彻底就位。
八月初四，再补朝堂重臣：宇文士及为中书令，封德彝为右仆射，杜淹为御史大夫，颜师古、刘林甫为中书侍郎