面对这批曾率兵猛攻玄武门、险些倾覆秦府的敌将，李世民毫无迁怒记恨之心，反而由衷感慨赞许：“你等昔日各为其主、誓死效忠，临难不苟、知恩图报，皆是世间忠义之士！”
于是尽数赦免三人所有罪责，既往不咎，悉数收纳任用、量才擢用，以此彰显胸襟、收服旧东宫势力人心。
大局安定之后，朝堂开启大规模人事更迭、论功行赏，全盘置换武德旧臣格局，建立以秦王府旧人为核心的全新执政班底，所有任免封赏，尽皆出自李世民授意，李渊仅保留签字颁诏的仪式权力，彻底沦为名义君主、无预国事。
武德九年七月初始，朝廷首批功臣任命落地：宇文士及授太子詹事；长孙无忌、杜如晦为太子左庶子；高士廉、房玄龄为太子右庶子；尉迟恭为左卫率；程知节为右卫率；虞世南为中舍人；褚亮为舍人；姚思廉为太子洗马。
此次论功定勋，以长孙无忌、尉迟恭功劳为第一等，各赐绢一万匹，厚赏殊恩、冠绝群臣。李渊更是特意单独嘉奖尉迟恭，亲口慰劳：“爱卿一举定乱、保全社稷、安定宫闱，有再造大唐之功！”
为彰其殊勋，李渊下旨，将原齐王国司所有库存金银、布帛、珍玩、器物，尽数全数赏赐尉迟恭，荣宠至极。
而整场玄武门之变中，布局最深、谋算最稳、掌控外军大局的李世勣，却未获任何即时加封赏赐，看似置身事外、毫无功勋。
此事绝非疏漏，而是李世民刻意精心布局的政治结果。
其一，事变之前，李世民特意未曾征召身在并州戍边的李世勣返京参与宫变。他早已谋算周全：李世勣手握北疆重兵、节制关外精锐，是秦王最坚实的外部底牌与退路屏障。
京城宫变凶险难料、生死未知，一旦玄武门起事失败、秦王身陷重围，只要李世勣手握外军、坐镇边关，李世民便可突围出城、直奔洛阳，依托关东基业与北疆重兵，再度起兵、抗衡东宫势力，依旧有翻盘一搏的资本。因此，必须保留李世勣在外统兵、超然事外，不可深陷京城政变漩涡。
其二，是为保全君臣名节、顾全朝野体面。
李世勣是武德朝老牌重臣、深得李渊信任倚重，素来立身中正、不结党营私。若是连他也公然参与逼宫政变、胁迫帝王，便等同于满朝文武尽皆胁君叛逆，李世民一朝将彻底坐实逼父弑兄、臣逼君上的骂名，沦为乱臣贼子格局，天下难以信服、后世难以定论。
故而李世民刻意将李世勣剥离出宫变核心，让