唯独有一处地利，可逆转兵力差距、实现精准狙杀、杜绝漏网之鱼——玄武门。
玄武门为皇宫正北正门，乃是天子禁中核心要道，宫城之内，禁军卫戍有严苛铁律：非诏不得擅入。东宫、齐王府兵马纵然人多势众、甲械精良，若无圣旨诏令，绝不能擅自闯入玄武门内，无法驰援二王、干预宫内变局。
李世勣精准抓住这一宫城规制漏洞，定下绝杀之计：
利用玄武门守将常何的人脉渊源布局。常何本为瓦岗旧部，乃是李世勣昔日嫡系旧将，素来亲厚可信、可受节制。由李世勣暗中联络常何，提前疏通门禁、布好伏兵、把控宫门守备。
待李渊下旨召集三兄弟入宫对质、议事之际，趁李建成、李元吉孤身入宫、无重兵护卫、隔绝府兵的绝佳时机，于玄武门内设伏，一举诛杀二王，永绝后患。
与此同时，李世勣思虑周全、算尽退路，并未让秦王府全部八百勇士尽数投入玄武门伏击，避免孤注一掷、全无后手。
他特意请李世民分出一百精锐卫士，交由秦琼亲自统领，固守秦王府全境，严密护卫王府家眷老小、文臣眷属，死守大本营、稳住后方根基。
这一百精锐作为最终退路与保全底线：若是玄武门伏击顺利、一举功成，则留守将士安稳守城、静待大局底定；若是玄武门起事意外失手、伏击败露、未能得手，便由秦琼即刻护送李世民全体家眷、府中亲信，连夜冲破长安城门，疾驰东去，直奔洛阳根据地，依托关东基业东山再起，保全火种、再图后计。
攻守兼备、进退有路、算尽成败、全无疏漏，玄武门惊天变局的整套周密布局，就此彻底敲定。