在这种情况下，商汤开始寻找更适合作为“灭夏基地”的都城。
经过多方考察与谋士伊尹的建议，商汤最终选择了“亳城”作为新的都城。
关于亳城的具体位置，历史上虽有多种说法（关中说、偃师西亳说、商丘南亳说、菏泽曹县北亳说等），但综合史料与考古发现来看，位于今河南商丘东南的“南亳”或山东菏泽曹县的“北亳”最为可信——这两个地点都具备以下优势：
靠近夏朝核心统治区，从亳城出发，向西可快速抵达夏朝的王都西河，便于商汤发动突袭；同时，亳城周边有淮河支流与黄河故道，水路交通便利，便于运输粮草与军队。
亳城地处黄河下游的冲积平原与丘陵地带交界处，周边有低矮山丘可作为天然屏障，同时可依托河流修建防御工事，易守难攻。
亳城周边土地肥沃，农业发达，可为商国提供充足的粮食储备；同时，这里是中原与东方、南方贸易的枢纽，商业繁荣，可积累灭夏所需的财富。
商汤决定迁都亳城的时间，是在夏桀十五年——这一年，夏桀正忙于修建“夜宫”，无暇顾及商国的动向，为商汤迁都提供了有利时机。为了确保迁都顺利进行，商汤采取了一系列周密的措施：
首先，秘密筹备。商汤下令在亳城秘密营建城池与宫殿，同时组织百姓开垦荒地，储备粮食。为了不引起夏桀的注意，商汤对外宣称“商丘遭遇洪水，需暂迁他地避灾”，并将部分老弱妇孺留在商丘，营造“只是临时迁徙”的假象。
其次，整合资源。商汤将商国的核心资源——包括青铜作坊、粮仓、军队主力等，全部转移至亳城。他还下令将从夏朝逃亡的流民、俘虏的奴隶集中到亳城周边，分配土地，让他们从事农业生产或手工业劳动，既充实了亳城的人口，又为灭夏积累了劳动力。
最后，安抚诸侯。商汤邀请与商国结盟的韦国、顾国、昆吾国等诸侯前往亳城，向他们展示亳城的防御工事与粮食储备，表明自己灭夏的决心与实力。同时，商汤承诺“灭夏之后，将夏朝的领土分封给各位诸侯”，进一步巩固了联盟关系。