洪熙十三年, 中书省右丞胡仕元案发，皇四子燕王朱霰领王府三卫与中都留守卫镇压叛军，救出被围剿的景昇帝、皇后与太子诸人。
这月初六日, 景昇帝将胡仕元党定罪为：“窃取国柄, 枉法诬陷, 操不轨之心，肆奸欺之蔽，嘉言于众舌，朋比呈于群邪, 蠹害政治，谋危社稷，譬堤防之将决，烈火之将燃, 有滔天燎原之势。”
景昇帝下令处死右丞胡仕元、左丞相汪广洋、御史大夫陈宁、中丞涂节、大都督府左都督丁玉。五人被押往玄津桥斩首，脑袋尸身滚作一团，被埋进一个两丈余深的大坑，第二日又将尸首挖出, 肢解于闹市, 纵恶犬食之。五人家财全部没入官，妻女分军士，男丁悉斩首。
参与兵变的濠梁濠、定远、长淮、皇陵四卫将兵全部坑杀。
在定“胡仕元之罪”的过程中还发生了一段小插曲。曾担任《元史》总裁官、太子之师的翰林院学士宋濂, 其告老还乡后因长孙宋慎“坐胡仕元党”被赐死。太子朱沶得知自己恩师被父亲赐死，向帝讨要特恩无果，竟然跳河以死表白护师之意。后经马皇后出面相劝, 当代巨儒宋濂才得以从死刑改为贬至茂州，途经夔州，不食二十日而死。
景昇帝下敕建造凤阳囚所, 在四周修筑高耸入云且坚固异常的城墙，用以囚禁犯罪宗室，终明一代，此宗室囚禁所都为帝王所用，俗称“高墙”。靖江王一脉削爵为民，子孙留在“高墙”之后世代务农。
至此，胡仕元一案暂告段落，总共杀了3万余人。
在杀光中书省所有大臣后，景昇帝索性罢中书省及丞相等官，仿周官六卿之制，提高六部地位。吏、户、礼、兵、刑、工每部设尚书一人，左右侍郎二人。六部尚书直接对皇帝负责，奉行政令。规定嗣君永不许立丞相，臣下敢有奏请设立者，文武群臣即劾奏，处以重刑。
接着，景昇帝下令分大都督府为中、左、右、前、后五军都督府。五军都督府直接对皇帝负责，奉行军令。
自此，中国终止了1600年的宰相制度，结束了“不经凤阁鸾台，何名为敕”的封驳制度，皇权、相权与军权合三为一，明代君权达到从古未有的高度，君王成了真正的天下至尊，而官僚沦为皇帝的奴才。
至此，朝廷既是帝王，帝王既是朝廷。景昇帝终成了独裁者。
景昇帝大刀阔斧改革军政政治制度后，又大肆封赏平叛有功之臣。
景昇帝赐秦、晋、燕三王苏州府吴江县良田各1