值得一提的是，他与六皇子之间的关系变得颇为微妙。在文华殿，他们是师徒，王明远讲授算学，六皇子认真听讲；在物料清吏司，他们是上下级，王明远汇报工作，六皇子听取建议，做出决策。在这种奇特的“亦师亦友”又兼上下级的关系中，两人倒是熟稔了不少。
但王明远始终保持着警惕。这位殿下年纪虽轻，但心思深沉，待人接物总是未语先笑，一团和气，可那笑眯眯的眼睛背后藏着什么，谁也看不透。
并且他时常还会有意无意地示好，或是关心王明远的起居，或是赞赏他的才干，但王明远回应得总是恭敬而克制，既不疏远，也不过分亲近。天家子弟的心思，尤其是这位看似温和的六皇子，他自认还摸不透，保持距离方为上策。