徐坚悬着的心，彻底放下了一半。杂菌污染的风险，已然避开，青霉菌的生长，一切正常，接下来，只要继续严格控制温度，确保环境适宜，青霉菌就会顺利进入发酵阶段，开始分泌青霉素。他再次调整了炭火的用量，确保温度稳定在25℃左右，同时，叮嘱小福子，加大值守力度，每隔半个时辰，便进屋查看一次，密切关注菌膜的生长情况，不可有半分疏忽。
第五日，菌膜开始增厚，边缘微微卷曲，呈现出淡淡的褶皱，培养液也渐渐从乳白转为淡黄，开始轻微浑浊。徐坚心中清楚，这是青霉菌开始发酵、分泌青霉素的信号——青霉菌在生长过程中，会消耗培养液中的营养，产生代谢产物，导致培养液浑浊，同时，开始分泌青霉素，溶解在培养液中。
他知道，发酵阶段，最关键的，就是控制温度和通风。温度过高，会导致青霉菌快速老化，停止分泌青霉素；温度过低，发酵速度会减慢，青霉素的产量会降低；通风不足，会导致菌膜腐烂变质，产生有毒物质，导致发酵失败。因此，他叮嘱小福子，加大通风频次，每隔一个时辰，便掀开薄木板，通风片刻，让新鲜空气进入，同时，严格控制温度，确保温度始终稳定在24-26℃之间。
小福子不敢有丝毫懈怠，严格按照徐坚的吩咐，按时通风，按时查看温度，密切关注菌膜的生长情况，一旦发现有异常，便立刻悄悄禀报徐坚。徐坚也每日都会前往耳房，查看发酵情况，记录温度、湿度，调整炭火和通风频次，确保发酵顺利进行。
第六日，培养液的浑浊度加深，转为深黄色，菌膜表面，出现了少量水珠，这是青霉菌发酵产生的代谢产物，也是发酵进入高峰期的信号——此时，青霉菌的生长速度最快，青霉素的分泌量，也达到了顶峰。徐坚看着眼前的培养液，心中满是笃定，他知道，发酵阶段，即将结束，再过一日，青霉素的发酵，便会彻底完成。
他再次叮嘱小福子，加倍小心值守，不可有半分疏忽，密切关注菌膜的变化，若是菌膜出现发黑、腐烂、有刺鼻异味等情况，立刻禀报，同时，严禁任何人靠近耳房，确保发酵原液的安全，不可有丝毫污染。
第七日，徐坚一大早